Ametyst jest trójdzielnym układem kryształów, kryształ jest sześciokątny, kolumnowy, cylindryczna powierzchnia jest poprzeczna, istnieje lewy kształt i prawy kształt, podwójny kryształ jest bardzo powszechny.Twardość wynosi 7. Kryształ często zawiera nieregularne lub uskrzydlone wtrącenia gazowo-cieczowe.